Die Foundation wurde ursprünglich im Juni 1998 als die Sakya Foundation mit Ihrer Eminenz Jetsün Kuchok als Vorsitzende gegründet. Sie wurde ins Leben gerufen, um ein Grundstück im Napa Valley zu halten, welches Ihrer Eminenz gespendet wurde, mit der Absicht, dass durch die Einnahmen des Verkaufs des Landes das Bauen eines Klosters oder andere wohltätige Zwecke ermöglicht würden.
Die Sakya Foundation erhielt im Mai 1999 gemäß seines Determination Letter des Internal Revenue Service den Status der Steuerbefreiung IRC 501(c)(3). Im Jahr 2015 entschied sich I.E. Jetsün Kushok dazu, zurückzutreten, und bat seine Heiligkeit den 42. Sakya Trizin Rinpoche, der Sakya Foundation vorzusitzen.
Seine Heiligkeit der 42. Sakya Trizin verlieh den neuen Namen „Sachen Foundation“ und der Name wurde offiziell beim Internal Revenue Service im Jahr 2017 geändert. Gemäß eines Determination Letters vom Dezember 2017 wurde der steuerfreie Status IRC 501(c)(3) anerkannt.